Σωρεία αντιδράσεων από Αλβανούς εντός και εκτός Σκοπίων και από τη Βουλγαρία έχει προκαλέσει η έκδοση της λεγόμενης «Μακεδονικής Εγκυκλοπαίδειας» από την Ακαδημία Επιστημών και Τεχνών της ΠΓΔΜ, στην οποία, μεταξύ άλλων, αναφέρεται ότι «οι Αλβανοί εγκαταστάθηκαν βιαίως τον 16ο αιώνα σε εδάφη της σημερινής Μακεδονίας, εκτοπίζοντας τους ντόπιους κατοίκους».

Οι διαμαρτυρόμενοι ισχυρίζονται ότι «οι Αλβανοί είναι γηγενείς στην περιοχή καταγόμενοι από τους αρχαίους Ιλλυριούς».
Στην εγκυκλοπαίδεια, επίσης, οι Αλβανοί αποκαλούνται «Σίπταρι», χαρακτηρισμός που θεωρείται προσβλητικός γι’ αυτούς, ενώ αναφέρεται ακόμη, ότι οι αντάρτες του UCK, εκπαιδεύτηκαν από Αμερικανούς και Βρετανούς, αναφορά που προκάλεσε αντιδράσεις και από την αμερικανική πρεσβεία στα Σκόπια.
Επίσης, ο ηγέτης των Αλβανών ανταρτών του UCK και νυν αρχηγός αλβανικού κόμματος, Αλί Αχμέτι, χαρακτηρίζεται «προσωπικότητα που διαδραμάτισε αμφιλεγόμενο ρόλο το 2001, τόσο στο εσωτερικό όσο και διεθνώς».

Ο Αλβανός πρωθυπουργός, Σαλί Μπερίσα, χαρακτήρισε απαράδεκτο το περιεχόμενο της εγκυκλοπαίδειας, κατά τη διάρκεια συνάντησης που είχε – στο περιθώριο της Γενικής Συνέλευσης του ΟΗΕ – με τον πρόεδρο της ΠΓΔΜ, Γκιόρκι Ιβάνοφ.
Σε ανακοίνωση του γραφείου του κ. Μπερίσα τονίζεται – μεταξύ άλλων – ότι ο Αλβανός πρωθυπουργός δήλωσε ότι θα ήταν απαραίτητη η παρέμβαση των ανωτάτων Αρχών της ΠΓΔΜ και η διατύπωση ξεκάθαρης θέσης για την ομαλοποίηση της κατάστασης, διότι «κανείς δεν μπορεί να δημιουργήσει ταυτότητα βασιζόμενος στη νοθεία της ιστορίας».

Από την πλευρά του, ο κ. Ιβάνοφ δήλωσε ότι μόλις επιστρέψει στα Σκόπια θα καταβάλλει προσπάθειες για την επίλυση του ζητήματος.
Η έκδοση έχει προκαλέσει την αντίδραση ακαδημαϊκών και ιστορικών στην Αλβανοί, ορισμένοι εκ των οποίων υποστηρίζουν ότι πίσω από αυτή την εγκυκλοπαίδεια κρύβεται «η κρίση ταυτότητας που αντιμετωπίζουν σήμερα τα Σκόπια».

ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΙΣ ΚΑΙ ΑΠΟ ΤΗ ΒΟΥΛΓΑΡΙΑ

Η πρεσβεία της Βουλγαρίας στην ΠΓΔΜ αντέδρασε για τη λεγόμενη «Μακεδονική Εγκυκλοπαίδεια» την οποία επιμελήθηκε η Ακαδημία Επιστημών και Τεχνών της ΠΓΔΜ «MANU».

Σε ανακοίνωση που εξέδωσε η βουλγαρική Πρεσβεία, αναφέρεται ότι στο σύγγραμμα χρησιμοποιείται λεξιλόγιο και ορολογία από την εποχή του Ψυχρού Πολέμου, κάτι που δεν συμβάλλει στην ανάπτυξη σχέσεων καλής γειτονίας.
Η πρεσβεία της Βουλγαρίας δεν προσδιορίζει για ποιες αναφορές της εγκυκλοπαίδειας έχει παρατηρήσεις, αλλά αναφέρει ότι τα κείμενα, τα οποία αφορούν τη Βουλγαρία, δεν αντικατοπτρίζουν τις μεταξύ τους σχέσεις και την τάση, που η Βουλγαρία επανειλημμένως επιδεικνύει με τις προθέσεις της, για στενότερη συνεργασία με την ΠΓΔΜ.

Τις προηγούμενες ημέρες, υπήρξαν αντιδράσεις από τις πρεσβείες των ΗΠΑ και της Μ. Βρετανίας, για τις αναφορές της εγκυκλοπαίδειας, ότι Αμερικανοί και Βρετανοί αξιωματικοί και ειδικοί εκπαίδευσαν τους Αλβανούς αντάρτες του UCK, κατά τη διάρκεια της διεθνοτικής κρίσης στην ΠΓΔΜ, το 2001.
 Στο μεταξύ, σφοδρή αντιπαράθεση μεταξύ του βουλευτή του κόμματος της αξιωματικής αντιπολίτευσης, «Σοσιαλδημοκρατική Ένωση» (SDSM) και πρώην πρωθυπουργού της ΠΓΔΜ, Βλάντο Μπουτσκόφσκι, και του πρωθυπουργού, Νίκολα Γκρουέφσκι, σημειώθηκε στη Βουλή, στη διάρκεια επερώτησης βουλευτών.
Ο κ. Μπουτσκόφσκι εγκάλεσε τον κ. Γκρουέφσκι για το γεγονός ότι προλόγισε τη «σκανδαλώδη» -όπως την χαρακτήρισε- εγκυκλοπαίδεια κατά τη σχετική παρουσίαση, που έγινε την περασμένη εβδομάδα, στα Σκόπια.

Ο κ. Γκρουέφσκι απέρριψε τις κατηγορίες ότι «παρότρυνε» την έκδοση της εγκυκλοπαίδειας αυτής και πρόσθεσε ότι τόσο ο ίδιος, όσο και η κυβέρνησή του, δεν έχουν το δικαίωμα να «αναμειγνύονται σε επιστημονικά έργα».